Le 12 janvier 1469, une bulle du Pape Paul II, confirmée par deux bulles du Pape Sixte IV le 13 mars 1473 et en 1479, supprima la régularité dans l'église de Luçon et sécularisa le Chapitre. Les anciens moines n'étaient donc plus soumis à la règle, sévère, de Saint-Benoît ; au lieu de vivre en communauté, ils pouvaient habiter désormais des maisons particulières et y vivre dans leurs meubles personnels avec leurs propres domestiques, à condition d'assurer les offices (matines, laudes, vêpres, bénédiction, etc…) et le culte divin dans la cathédrale qui leur était réservée. Le Chapitre, constitué de 43 chanoines nommés par l'évêque, présidé par un Doyen élu par le Chapitre et assisté de 11 dignitaires (archidiacres, chantre, prévôt, chancelier, etc..), constitue en théorie le conseil de l'évêque, mais sans avoir des pouvoirs effectifs dans le diocèse (sauf en cas de vacance du siège épiscopal). Le Chapitre est riche et possédera au 18ème siècle la châtellenie de Triaize (4.753 hectares aux portes de Luçon répartis en 20 « cabanes » très importantes, celle du Clos-1'Abbé atteignant 453 hectares), le canal de Luçon, voie d'accès à la mer, avec ses péages, mais aussi ses charges d'entretien, une trentaine de prieurés (dont celui des Mignons), leurs maisons canoniales et 323 hectares en prés à Luçon. La gestion de ce riche domaine, loué à des fermiers, accapare l'activité des plus dynamiques et laisse en moyenne à chaque chanoine à la veille de la Révolution un revenu fort appréciable un peu supérieur à 3.000 livres (alors que la retraite d'un lieutenant-colonel, vieux soldat, est voisine au mieux de 1.000 livres), d'où la pseudo-épitaphe ironique rapportée par Colbert de Croissy :

Deux mentions du Gallia Christiana (II, Instr., 395 et 397) indiquent le 12 janvier 1468 que la ½ des revenus du prieuré est attribuée à Guillaume Prévost, chanoine du Chapitre sécularisé de Luçon, et 1/3 à Jacques Bignet, un familier du Pape qui venait d'être nommé archidiacre de Pareds, sans que nous sachions à qui revenait le 1/6 restant.